В основу архитектурного облика станции «Юго-Восточная» легли восточные мотивы. Такое решение архитекторы приняли, исходя из топонимических имен расположенных рядом улиц – Ферганской и Ташкентской, названных в честь городов в Узбекистане. Потолок станции украсили плафоны, напоминающие очертания куполов минаретов, а разделительная стена между путями выполнена в виде перевернутых арок.
Тематика Среднеазиатского региона отражена и в цветовом решении станционного комплекса, где преобладают оттенки бежевого, желтого, серого и черного. На полу уложены гранитные плиты, а стены отделаны травертином и полированным известняком.
Специалисты «МИПСТРОЙ 1» выполнили весь комплекс строительных работ в рамках проекта станции «Юго-Восточная».